大学文書史料室の所蔵資料は、「神戸大学特定歴史公文書等データベース」（所蔵目録）で検索できます。
また、「国立公文書館デジタルアーカイブ横断検索システム」では国立公文書館の所蔵資料との横断検索も可能です。